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单细胞转录组
1 单细胞产品类型
2 样本寄送流程及注意事项
2.1 新鲜组织及血液样本寄送
2.1.1 寄送流程
用组织保存液保存新鲜组织进行寄送,基本流程如下:2.1.2 组织保存液寄送样本
客户收到组织保存液后(见STEP2图),组织保存液应在4℃条件下保存(效期3个月,有沉淀/冻融后不可使用),切勿冻存; 寄样时,先将样本放入装有组织保存液的储存管中,组织尽量无菌放入液体中,组织保存液应当浸没组织,然后迅速盖紧加封口膜包装好。 组织保存液寄送样本小Tips: Step1、首先准备一个泡沫箱和适量冰袋,注意请勿使用-80℃冰箱冰袋用于邮寄样本 Step2、标明样本名称,用适量的塑料泡沫对装有组织的保存液管进行包裹 Step3、确保管子包裹完好 Step4、用保鲜膜或者胶带封好 Step5、置于冰袋上,保证不和冰袋直接接触 Step6、找一些填充物进行填充,确保样本在其中不会过多震荡 注意:寒冷天气下,可借助保温桶等设备防止组织结冰常规组织 | 肿瘤、器官组织等 | 绿豆 |
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达到0.08g可以尝试有风险,细胞量可能偏少。 |
黄豆 |
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正常,可以尝试,细胞量通常可以达到上机要求。 | ||
花生 |
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正常,可以尝试,细胞量通常十分充足。 | ||
骨组织样本 | 软骨类 | 花生 |
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软骨组织需要1g(一颗中等花生米大小)以上的组织量,达到送样量通常消化后细胞量充足。 |
硬骨类 | 成人中指指甲大小(2-3块 |
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硬骨组织需要10g以上的送样量,可事先用骨钳将组织处理成1cm*1cm左右的小块(10g大约2.5-3块左右),达到送样量通常消化后细胞量充足。 | |
血管类 | 人主动脉、肺动脉及静脉 | 花生壳 |
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要求送样量达到1g为宜,组织量大约为一个花生壳大小(1cm*2.5cm)。 |
小鼠血管 | 2根 |
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数量若干根,总量达到6cm为宜 | |
其他类型 | 穿刺样本 | 直径1mm穿刺条(大致曲别针粗细) |
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长度>2cm,可以尝试,细胞量无法保证;2cm>长度>0.5cm,有一定风险,可以尝试,细胞量有可能无法达到上机要求;长度<0.5cm∶高风险,不建议送样。 |
小鼠十二指肠绒毛 | 建议2cm长度 |
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一只成年小鼠全部十二指肠绒毛 组织要求:切除十二指肠,将肠内容物轻轻冲洗干净,待到制备前打开肠道,刮下绒毛。 运送时间:最好在6h内制备并上机。不建议寄送。 | |
鼠类胰腺 | 如图组织量可以制备千万级细胞 |
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一只成年小鼠,细胞量足够 组织要求:干净的胰腺,剔除肠系网膜。 运送时间:最好24h之内。 运输条件:申请特殊组织保护液(胰腺/胰腺癌) |
2.2 新鲜细胞悬液仅适用于同城寄送
(1)客户自选缓冲液需注意选用无钙、镁、EDTA等影响酶活性物质,官方推荐含0.04% BSA的PBS; (2)细胞量尽量保证在1×106cells以上; (3)如需流式分选,分选后目的细胞尽量保证在1×105cells以上(寄送前提前联系); (4)冰袋寄送(注意不要选择干冰),寄送时装有样本的储存管不能和冰袋直接接触,需用泡沫包裹,保证4℃左右的低温环境; (5)寄送时间小于4小时;2.3 冻存细胞干冰寄送
2.3.1 客户冻存细胞寄送方法
2.3.2 细胞冻存方法
(如客户细胞尚未冻存,可参考如下冻存方法) 1)将制备好的单细胞悬液离心(300-500g,5分钟,4℃),去上清,细胞缓冲液重悬后计数(浓度700-1200 cells/μL),调整细胞总量5-10×106cells(冻存细胞风险较大,如需流式需提前跟客户说明风险); 2)备注:客户实验室需备台式冷冻离心机(水平转子15mL离心管适配器);注意试剂和仪器无菌,操作过程要求无菌操作; 3)对于活性大于80%的细胞进行离心(300-500g,5分钟,4℃),去上清,加入冻存液,重悬细胞,然后将1mL细胞悬液加入到细胞冻存管中,拧紧盖子; 4)将细胞冻存管放到程序降温盒中(推荐异丙醇冻存盒);将程序降温盒放入到-80℃,24小时后选择干冰寄送或者液氮保存; 5)干冰寄送:将细胞冻存管放到干冰中,冻存管做好标记(样本名称、冻存时间、客户单位、姓名),选择干冰15-20公斤(夏季可以适度增加)。2.4 冻存组织寄送(液氮速冻组织寄送抽核处理)
冻存组织基本流程如下:2.5 植物样本寄送
(1)植物样本要求 植物类样本支持原生质体制备与植物抽核制备,均需寄送活株。 寄送过程中可以使用木架固定培养瓶及幼苗,以保证运输途中植物完整性及状态的稳定性。 制备的目标组织量建议>2g,幼嫩组织优先,木质含量高的组织类型成功率不稳定,需客户知悉。 (2)关于特殊样本类型 含淀粉样本(如甘薯、人参、三七、马铃薯等)无法进行原生质体制备,只能抽核处理; 对于抽核类样本,如样本涉及真菌侵染、细菌处理、病毒、虫害等处理,需要确认样本详细情况,是否存在寄生/残留,如有残留/寄生,则无法通过流式进行核悬液的纯化实验。2.6 动物样本寄送
(1)常规样本 对于常规动物组织样本、血液等,上机要求和单细胞转录组捕获上机质检标准一致,寄送要求同2.1-2.4送样建议; 其中血液(全血)/骨髓样本,如需制备PBMC/BMMC,除人和小鼠之外,其余物种均需要联系云顶国际进行评估。 制备的目标组织量建议>2g,幼嫩组织优先,木质含量高的组织类型成功率不稳定,需客户知悉。 (2)非常规样本 对于非常规样本,诸如鱼类、贝类等,建议进行活体寄送,放置在养殖液体中,充氧寄送至天津实验室。(解剖需老师协助)2.7 类器官组织寄送
送样建议:类器官细胞得率低,建议尽可能多提供,或进行预实验测试细胞得率2.8 FFPE样本寄送
(1)石蜡块:优先建议提供石蜡块(带卡槽),要求被包埋组织横截面积>0.5cm2,蜡块密封后冰袋寄送 (2)石蜡卷:要求石蜡卷现切现用,先送质检样本,质检合格后再送正式样本 质检样本要求:5?m厚度5-6卷,现切现用(7天之内),置于EP管内,密封后冰袋寄送; 正式样本要求:25um厚度4-6卷,现切现用(7天之内),每两张石蜡卷,置于一个1.5ml EP管内,密封后冰袋寄送,切片厚度不可减小,需保证石蜡卷完整性; FFPE样本寄送至天津单细胞实验室,质检样本/正式样本均需要制备预警邮件,并附件FFPE样本基本信息,如FFPE样本寄送至样本组,务必备注样本放于4℃,切勿放在-80℃2.9 体液类/冲洗液类样本寄送
(1)送样建议:无菌取样,提取体液后,直接放入15ml或者50ml离心管中,并做好标记。由于此类样本细胞得率低,建议尽可能多提供。 (2)样本寄送:置于4℃环境进?保存运输。3 样本寄送信息
3.1 天津
新鲜样本/FFPE样本/捕获完成的cDNA:单细胞样本接收员:18522138772 冻存组织:云顶国际样品组:18526699037 邮寄地址:天津市武清开发区创业总部基地B073.2 北京
1)建议销售经理直送到公司,其次选择闪送,送样前与北京样本接收员联系: 2)样本接收员:15692242863 地址:北京市朝阳区酒仙桥北路甲10号院301号楼1013.3 广州
1)建议销售经理直送到实验室 2)样本接收员:13212047356 地址:广东省广州市黄浦区开源大道11号C6栋西门7023.4 上海
1)建议销售经理直送到实验室 2)样本接收员:17602619385 地址:上海市闵行区绿洲环路790号生命健康科学城9号3幢3.5 成都
1)建议销售经理直送到实验室 2)样本接收员:18522589457 地址:四川省成都市武侯区国学巷37号华西医院医学转化楼8楼3.6 杭州
1)建议销售经理直送到实验室 2)样本接收员:13001325524 地址:浙江省杭州市余杭区留泽街3号楼三楼4 注意事项
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